L'Assemblée Générale, organe statutaire souverain, est le lieu de définition des orientations politiques du CNAJEP. Elle adopte chaque année le rapport d'activité, le rapport financier et les comptes du CNAJEP.
Instances

Le Comité Exécutif, élu par l'Assemblée Générale pour deux ans, est chargé de la mise en œuvre et du suivi des orientations du CNAJEP. Composé de 18 membres, il élit en son sein le Bureau et le Président.
Les associations membres du Comité Exécutif du CNAJEP sont les suivantes :
Il est constitué de 9 membres :
Les associations membres du Comité Exécutif du CNAJEP sont les suivantes :
- L'Association nationale des conseils d'enfants et de jeunes (ANACEJ)
- Les Centres d'Entrainement aux Méthodes d'Education Active (CEMEA)
- La Confédération des MJC de France (CMJCF)
- Cotravaux
- CPCV Union Nationale (Organisme Protestant de Formation)
- Culture et Liberté
- Les Eclaireuses et les Eclaireurs de France (EEDF)
- La Fédération des Associations Générales Etudiantes (FAGE)
-
La Fédération Française des Maisons des Jeunes et de la Culture (FFMJC)
- La Fédération Léo Lagrange (FLL)
- La Fédération Sportive et Gymnique du Travail (FSGT)
- La Fédération Nationale des Francas
- La Jeunesse Ouvrière Chrétienne (JOC)
- La Jeunesse au Plein Air (JPA)
- La Ligue de l'Enseignement)
- Le Mouvement Rural de Jeunesse Chrétienne (MRJC)
- Les Scouts et Guides de France (SGDF)
- L'Union Nationale pour l'Habitat des Jeunes (UNHAJ)
Le Bureau est l'instance qui valide et engage le CNAJEP dans la mise en œuvre des orientations et dans son expression politique.
Il est constitué de 9 membres :
- Une présidente, Irène PEQUERUL (Fédération nationale des Francas)
- Un secrétaire général, Mikaël GARNIER-LAVALLEY (Anacej)
- Une trésorière, Françoise DORÉ (Cotravaux)
-
Six membres :
- Catherine BERNARD (CMJCF)
- Maïka BILLARD (SGDF)
- Jean-Luc CAZAILLON (CEMEA)
- Nadine DUSSERT (UNHAJ)
- David LOPEZ (Ligue de l'Enseignement)
- Florian MEYER (JOC)



